Бухгалтерия является структурным подразделением филиала университета, осуществляющим следующие функции:

1. Организация бухгалтерского учета основных фондов, материальных запасов, денежных средств и других ценностей филиала.
2. Организация расчетов с контрагентами по хозяйственным договорам, с бюджетом и внебюджетными фондами.
3. Начисление и выплата заработной платы, своевременное проведение расчетов с сотрудниками филиала.
4. Обеспечение строгого соблюдения кассовой и расчетной дисциплины, расходования полученных в учреждениях банков (кредитных организациях) средств по назначению.
5. Осуществление предварительного контроля за своевременным и правильным оформлением документов и законностью совершаемых операций.
6. Применение утвержденных в установленном порядке типовых унифицированных форм первичной учетной документации, строгое соблюдение порядка оформления этих документов.
7. Обеспечение своевременного и правильного отражения на счетах бюджетного учета и в отчетности хозяйственных операций.
8. Организация контроля за сохранностью нефинансовых активов и денежных средств.
9. Составление и представление в установленные сроки бухгалтерской и статистической отчетности, отчетности в государственные социальные внебюджетные фонды, налоговых деклараций и пояснений к ним.
10. Принятие мер к предупреждению недостач, растрат и других нарушений и злоупотреблений.
11. Проведение инструктажа материально ответственных лиц по вопросам учета и сохранности ценностей, находящихся на их ответственном хранении.
12. Осуществление контроля за своевременным проведением и участие в проведении инвентаризации активов и обязательств организации, своевременное и правильное отражение результатов инвентаризации в бухгалтерском учете.
13. Составление и согласование с директором филиала (при отсутствии экономиста) плановых калькуляций, смет расходов и расчетов к ним.
14. Участие в проведении анализа финансово-хозяйственной деятельности организации с целью выявлений внутрихозяйственных резервов, ликвидации потерь и непроизводительных расходов.
15. Осуществление мероприятий по повышению уровня автоматизации учетно-вычислительных работ.
16. Систематизированный учет положений, инструкций, других нормативных актов по вопросам организации и ведения бюджетного учета.
17. Обеспечение хранения бухгалтерских документов, регистров учета, иных документов, связанных с деятельностью бухгалтерской службы и бухгалтерского архива.