Целью приоритетного направления развития «Экономическая безопасность» является изучение проблем экономической безопасности и управления рисками в деятельности хозяйствующих субъектов, содействие повышению эффективности органов законодательной и исполнительной власти в области нормативно-правового регулирования и построения систем обеспечения экономической безопасности, а также их внедрения на практике.

В рамках указанного направления планируется осуществить:

• комплексный стратегический анализ и долгосрочный прогноз состояния экономической и национальной безопасности в целом, что будет служить основой для выбора стратегических национальных приоритетов;
• целевую программу исследований комплексного подхода к оценке интегрального риска по всем направлениям деятельности организаций, независимо от их форм собственности и уровня капитализации;
• разработку методологической основы для экспертно-консультационной работы на уровне Правительства РФ при разработке и оптимизации механизмов минимизации рисков и угроз экономической безопасности;
• определение пороговых значений национальной экономической безопасности по основным стратегическим направлениям жизнеобеспечения развития регионов России; 
• подготовку методических предложений в адрес органов исполнительной власти по формированию системы обеспечения экономической безопасности, в том числе предложения по совершенствованию нормативной базы в сфере стратегического планирования развития регионов;
• разработку методик выявления и мониторинга внешних и внутренних факторов, оказывающих влияние на безопасность социально-экономического развития регионов России;
• обобщенный анализ мирового и отечественного опыта противодействия теневой экономике, противодействия коррупции и мошенничеству на федеральном, региональном и корпоративном уровнях, а также иным правонарушениям экономической направленности;
• разработку методических рекомендаций по оценке эффективности борьбы с теневой экономикой, противодействия коррупции и мошенничеству на федеральном, региональном и корпоративном уровнях; 
• обоснование основных принципов и порядка нормативного регулирования мер, направленных на борьбу с теневой экономикой, коррупцией, мошенничеством на федеральном, региональном и корпоративном уровнях; 
• разработку методов построения механизмов стимулирования исполнения государственных программ по борьбе с теневой экономикой, коррупцией, мошенничеством и иными правонарушениями экономической направленности, подрывающими экономическую безопасность;
• подготовку предложений по совершенствованию нормативно-правовых основ обеспечения экономической безопасности.